Προβληματική είναι η κατάσταση που επικρατεί στο Νοσοκομείο της Καστοριάς όσον αφορά την απρόσκοπτη και εύρυθμη λειτουργία του. Όπως επισημαίνει και η Ένωση Ιατρών Νοσοκομείων και Κέντρων Υγείας Δυτικής Μακεδονίας, η υποστελέχωση που υφίστανται σε καίριες ειδικότητες ιατρικού προσωπικού, δημιουργεί πρακτικά ζητήματα εξυπηρέτησης. Πιο συγκεκριμένα, συνεχίζεται η απουσία πνευμονολόγου μέχρι και σήμερα και μάλιστα σε ένα νοσοκομείο που υπήρξε από την πρώτη στιγμή στην πρώτη γραμμή στη μάχη κατά της Covid-19. Το γεγονός αυτό δημιουργεί τεράστια κενά και ελλείψεις που καλούνται να καλύψουν άλλες ειδικότητες, καθώς η πανδημία είναι σε εξέλιξη.
Επιπρόσθετα, σε κλινικές όπως η Καρδιολογική και η Παθολογική, αλλά και στο Ακτινολογικό και το Αναισθησιολογικό Τμήμα, υπάρχει μεγάλο πρόβλημα από την υποστελέχωση και οι υπάρχοντες ιατροί έχουν οδηγηθεί σε εργασιακή εξουθένωση, υπερβάλλοντας εαυτόν, ώστε να μπορούν να ανταποκριθούν στα καθήκοντά τους προς όφελος των πολιτών. Επειδή δεν υπήρξαν οι απαραίτητες προσλήψεις μόνιμου προσωπικού εν μέσω της πανδημίας Covid-19, το νοσοκομείο βρίσκεται σε τροχιά πλήρους υποβάθμισης, με έντονα προβλήματα τόσο στη λειτουργία των κλινικών και των ΤΕΠ, όσο και στις εφημερίες πολλών άλλων τμημάτων και παρά το γεγονός ότι το νοσοκομείο της Καστοριάς ήταν από τα πρώτα νοσοκομεία της Ελλάδας που βρέθηκε στην πρώτη γραμμή της μάχης κατά της πανδημίας, με όλο το προσωπικό του να υπερβάλλει εαυτόν προκειμένου να ανταπεξέλθει στην μεγάλη διασπορά της Covid-19.